美国时间4月13日，美国疾病控制与预防中心（CDC）和美国食品药品监督管理局（FDA）发布联合声明，公布了强生疫苗的接种者中的极端副作用案例：6名18岁至48岁的女性在接种强生疫苗后的6至13天中，出现血小板减少的症状，形成了罕见的脑静脉窦血栓。目前6名患者中已有一人死亡，一人生命垂危。 

对此，CDC方面表示，将在4月14日召开专家会议重新评估上述案例，FDA方面也将展开研究。同时，两大机构要求，立即停止使用强生新冠疫苗。 

截至4月13日，美国纽约州、康涅狄格州、马萨诸塞州、新泽西州等19个州，已宣布暂停接种强生疫苗。

同日，强生公司表示，将主动推迟新冠疫苗在欧洲的供给，暂停该疫苗在临床试验中的接种，并为研究人员和参与者更新指南。

暂停强生疫苗的接种后，美国可能面临大约3000万剂疫苗缺口。强生疫苗是美国第三款获批紧急使用的疫苗，其优势在于易运输和存储，只需一针即可完成接种。据美国CDC的数据报告，截至4月13日，美国已有680万人接种该款疫苗，还有900万剂疫苗已分发至各州。

对此《华盛顿邮报》称，在密歇根州病例激增、全美范围内疫情曲线持续上升的现状下，该项紧急停用举措可能会延缓美国应对疫情的进程。

4月13日，美国总统拜登对此回应称，即便没有强生和阿斯利康的疫苗，现在全美的疫苗供应也已经足以让“每一个美国人”得到接种。纽约州和加州部分地区已宣布，对已在接种点预约强生疫苗的人士，将改为接种辉瑞或莫德纳公司新冠疫苗。

美国辉瑞公司首席执行官13日表示，公司已加快新冠疫苗生产进度，尽早完成交付任务。该公司可能在6月中旬生产3亿支新冠疫苗，提前两周完成交付目标。另外，5月底之前的疫苗供应量也将提高10%。

此前，阿斯利康疫苗此前也因血栓问题被多国叫停接种，该疫苗与强生同样采用腺病毒载体技术。世界卫生组织对此表示，接种阿斯利康疫苗与发生血栓之间的因果关联尚未得到证实。国内疫苗专家陶黎纳持相似观点，并表示腺病毒有复制缺陷并不会在人体中造成感染。